基因组编辑领域迎来一个里程碑式的突破:印度农业研究委员会(ICAR)中央水稻研究所(CRRI)的研究团队成功开发并验证了一套AI设计的植物基因组编辑平台——Plant OpenCRISPR-1(POC1),相关研究已被国际植物科学期刊《New Phytologist》接收。

AI设计的手术刀:首次在植物中验证

迄今为止,植物基因组编辑工具所依赖的核酸酶蛋白全部来源于细菌和其他天然微生物。而POC1平台的核心核酸酶OpenCRISPR-1(OC1)是由人工智能设计的全新核酸酶——这意味着科学家不再受限于自然界中已有的编辑工具。

ICAR-CRRI团队基于OC1开发了一系列POC1工具:
- 基因敲除工具:在多个水稻基因中实现了与广泛使用的SpCas9系统相当的编辑效率
- 碱基编辑工具:能够精确修改DNA上的单个字母,实现靶向作物改良
- 引导编辑工具:具备更精确的搜索-替换能力,可重写遗传密码

为什么这很重要?

第一,打破专利垄断。 SpCas9作为目前最广泛使用的CRISPR核酸酶,其核心专利掌握在少数机构手中,高昂的许可费用限制了广泛使用。OC1作为开源核酸酶,计划对学术研究免费开放,也可用于商业授权,有望大幅降低基因组编辑的门槛。

第二,AI设计的蛋白质在植物中可工作。 这是AI设计的酶首次被证明能在植物细胞中高效工作,为此前未被报道过的能力。这意味着未来可以通过AI设计出更多定制化核酸酶,满足不同作物和基因靶点的编辑需求。

第三,印度的生物技术崛起。 这项研究反映了印度在人工智能、基因组编辑、生物技术和农业科学交叉领域的能力正在快速发展,对印度的粮食安全目标具有重要意义。

对中国种业的警示

中国在CRISPR技术的基础研究方面已有不少突破,但在底层工具的原创开发上仍与欧美存在差距。印度ICAR团队的这一成果提醒我们,不仅欧美在追赶,印度等新兴经济体也在基因组编辑领域加速布局。

值得关注的是,中国已经正式实施农业植物实质性派生品种(EDV)制度,种业知识产权保护体系日趋完善。在这样的政策背景下,掌握原创基因组编辑工具将变得愈发重要——不仅是为了育种创新,更是为了在国际种业竞争中拥有底牌。

来源:ICAR中央水稻研究所

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